编号：Hoechst 染料是用于染色 DNA 的蓝色荧光染料家族的一部分。这些双苯亚胺最初是由 Hoechst AG 开发的，该公司对其所有化合物进行了编号，比如染料 Hoechst 33342 是该公司生产的第 33342 种化合物。

激发/发射光谱：有三种相关的 Hoechst 染料：Hoechst 33258、Hoechst 33342 和 Hoechst 34580。三种染料都可被大约350 nm 的紫外光激发，并且都在 461 nm 的最大发射波长附近发出蓝色/靛色荧光。染料Hoechst 33258 和 Hoechst 33342 是最常用的染料，激发/发射光谱也比较接近。未结合染料在510-540 nm 范围内具有最大荧光发射。

差异：Hoechst 33342 的额外乙基使其更具亲脂性，渗透膜的能力比 Hoechst 33258 更强。可以向 Hoechst 33258 中添加氯乙基，溴乙基，氯丙基等基团制备一系列 Hoechst 33258 的 氨基甲酸酯衍生物作为潜在的抗癌药。

溶解和储存：Hoechst染料可溶于水和有机溶剂，如二甲基甲酰胺或二甲基亚砜。浓度最高可达 10 mg/mL 。避光时，水溶液在 2-6°C 下可稳定至少六个月。对于长期储存，溶液需在 ≤-20 °C 下冷冻。

工作液：使用PBS 或者其他合适缓冲液将母液稀释成 0.5-10 μg/mL 工作液。工作液浓度可根据自身实验需要进行调整。

染料与双链DNA 的小沟结合，优先选择富含腺嘌呤和胸腺嘧啶的序列。尽管染料可以与所有核酸结合，但富含 AT 的双链 DNA 链可显着增强荧光。 Hoechst 染料具有细胞渗透性，可以与活细胞或固定细胞中的 DNA 结合，通常用作另一种核酸染色剂（DAPI）的替代物。因此，这些着色通常被称为超活体，这意味着细胞在这些化合物的处理下存活下来。表达特定ATP 结合盒转运蛋白的细胞也可以主动将这些染色剂转运出细胞质。